En 1994, la Fundación Canguro, una institución colombiana sin ánimo de lucro, fue creada por un grupo de profesionales con el interés de evaluar y difundir el Método Madre Canguro (MMC) colombiano de manera científica tanto para Colombia como para el mundo. La primera investigación realizada fue un estudio de cohortes cuyos resultados fueron publicados en 1994 en la revista Pediatrics; este estudio demostró que el MMC tenía una efectividad similar al manejo tradicional en incubadora de los recién nacidos prematuros o con bajo peso al nacer (BPN) en Colombia. Posteriormente, para demostrar la efectividad y seguridad del MMC, la Fundación Canguro realizó el primer ensayo clínico aleatorizado sobre esta intervención entre 1993 y 1996, encontrando resultados positivos a corto, mediano y largo plazo en términos de supervivencia, lactancia materna, calidad del vínculo madre-bebé y neurodesarrollo al año de edad corregido; estos resultados también fueron publicados en revistas indexadas.

Desde entonces, la Fundación Canguro ha seguido desarrollando investigaciones clínicas para mejorar diferentes aspectos del MMC, como la nutrición canguro, el seguimiento y los resultados neurológicos, el MMC y el desarrollo cerebral mediante estudios de imagen, el manejo ambulatorio de lactantes oxígeno-dependientes, así como instalando un seguimiento bianual de la calidad del MMC a partir de los datos de 3 centros de excelencia en MMC de Bogotá y Medellín, en los que colabora la Fundación Canguro. Estos centros reciben pacientes prematuros o con BPN de todos los niveles socioeconómicos, lo que permite a la Fundación Canguro evaluar realmente el impacto del MMC en la salud de estos pequeños vulnerables, también se siguen los protocolos y directrices técnicas para la Implementación de Programas Madre Canguro (PMC) en Colombia, publicados por el Ministerio de Salud en 2017. En Colombia existen 66 PMC que siguen estos lineamientos técnicos canguro y realizan seguimiento de alto riesgo hasta el año de edad. En un estudio nacional organizado por la Fundación Canguro en 2022 encontramos solo un 63,2% de acceso para todos los recién nacidos prematuros y bebés de BPN. Actualmente, no existe una auditoría de la calidad del MMC ni un análisis de los indicadores a nivel nacional, de ciudad o regional.